Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RGPD2P0DJD1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms