Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM200BP0CF97 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms