Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGAP02671 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGAP02671 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGAP02671 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGAP02671 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGAP02671 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGAP02671 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGAP02671 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGAP02671 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FGAP02671 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FGAP02671 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FGAP02671 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGAP02671 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGAP02671 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGAP02671 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FGAP02671 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FGAP02671 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms