Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBF1O95248 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBF1O95248 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBF1O95248 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBF1O95248 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBF1O95248 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SBF1O95248 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SBF1O95248 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBF1O95248 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBF1O95248 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBF1O95248 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SBF1O95248 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBF1O95248 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SBF1O95248 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SBF1O95248 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SBF1O95248 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SBF1O95248 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SBF1O95248 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBF1O95248 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SBF1O95248 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBF1O95248 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBF1O95248 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SBF1O95248 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBF1O95248 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBF1O95248 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBF1O95248 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SBF1O95248 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms