Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CTSVO60911 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSVO60911 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSVO60911 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSVO60911 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSVO60911 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSVO60911 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CTSVO60911 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTSVO60911 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTSVO60911 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms