Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC7A4O43246 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC7A4O43246 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms