Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHADO15335 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHADO15335 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHADO15335 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHADO15335 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHADO15335 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHADO15335 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHADO15335 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHADO15335 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHADO15335 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHADO15335 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHADO15335 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHADO15335 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms