Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLR1CO15160 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR1CO15160 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms