Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POLRMTO00411 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POLRMTO00411 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms