Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFKBIEO00221 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms