Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERVV-1B6SEH8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVV-1B6SEH8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms