Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
B4DXG7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
B4DXG7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
B4DXG7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
B4DXG7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
B4DXG7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
B4DXG7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms