Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC169A6NNP5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC169A6NNP5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms