Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTL1A6NKG5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTL1A6NKG5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms