Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 PPP1R12A-208ENST00000547330 2275 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.354e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-215ENST00000481971 570 ntTSL 412.72□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RAB5A-202ENST00000412966 622 ntTSL 312.5□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.414e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-207ENST00000560784 717 ntTSL 511.58□□□□□ -0.564e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 MLF2-207ENST00000540710 458 ntTSL 311.09□□□□□ -0.634e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-201ENST00000334660 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-202ENST00000392151 1000 ntTSL 210.81□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-209ENST00000561280 572 ntTSL 410.81□□□□□ -0.684e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-203ENST00000558351 766 ntTSL 59.87□□□□□ -0.834e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-217ENST00000488172 648 ntTSL 49.11□□□□□ -0.954e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 CHP1-204ENST00000560397 568 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.974e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RFWD3-211ENST00000575397 841 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 INTS3-209ENST00000503133 1896 ntTSL 28.38□□□□□ -1.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-218ENST00000485538 570 ntTSL 38.34□□□□□ -1.074e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RNF10-205ENST00000535417 546 ntTSL 38.16□□□□□ -1.14e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-212ENST00000473060 2492 ntTSL 27.85□□□□□ -1.154e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-211ENST00000469636 1792 ntTSL 37.59□□□□□ -1.194e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-228ENST00000498469 879 ntTSL 27.27□□□□□ -1.254e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-214ENST00000477006 452 ntTSL 37.21□□□□□ -1.264e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-205ENST00000439509 584 ntTSL 36.89□□□□□ -1.314e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-208ENST00000447264 794 ntTSL 56.89□□□□□ -1.314e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-223ENST00000491357 741 ntTSL 36.53□□□□□ -1.364e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 INTS3-205ENST00000476843 3404 ntTSL 1 (best)6.44□□□□□ -1.384e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 ACSS2-204ENST00000464399 358 ntTSL 56.05□□□□□ -1.444e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.484e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.554e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.564e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.64e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 RAB5A-206ENST00000469122 918 ntTSL 24.84□□□□□ -1.634e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-217ENST00000485139 575 ntTSL 44.71□□□□□ -1.664e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 SLC37A3-225ENST00000492027 551 ntTSL 44.7□□□□□ -1.664e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 NAA15-203ENST00000468029 530 ntTSL 34.67□□□□□ -1.664e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 PPP1R12A-211ENST00000550001 631 ntTSL 54.46□□□□□ -1.74e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 PPP1R12A-206ENST00000547131 897 ntTSL 54.44□□□□□ -1.74e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 PPP1R12A-221ENST00000553081 1101 ntTSL 53.26□□□□□ -1.894e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 FXR1-204ENST00000461044 601 ntTSL 42.83□□□□□ -1.964e-6■□□□□ 8.1
SF3B4Q15427 AP2A2-211ENST00000527917 261 ntTSL 37.52□□□□□ -1.218e-10■□□□□ 8
SF3B4Q15427 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 23.63□□□□□ -1.833e-33■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-203ENST00000378054 653 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-205ENST00000468943 679 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-206ENST00000476555 580 ntTSL 313.48□□□□□ -0.252e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-207ENST00000620958 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-12■□□□□ 8
SF3B4Q15427 GMNN-204ENST00000378059 688 ntTSL 23.88□□□□□ -1.792e-12■□□□□ 8
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