Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC61Q9Y6R9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC61Q9Y6R9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms