Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UTP11Q9Y3A2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UTP11Q9Y3A2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms