Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC49.63■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC49.63■■■■■ 5.54
NISCHQ9Y2I1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.61■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC49.61■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.6■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC49.6■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC49.6■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.6■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.58■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC49.58■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC49.57■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC49.57■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
NISCHQ9Y2I1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC49.56■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC49.55■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC49.54■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC49.54■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC49.54■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC49.54■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC49.53■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC49.53■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC49.51■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC49.51■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.52
NISCHQ9Y2I1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC49.49■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.49■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC49.49■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.48■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC49.48■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
NISCHQ9Y2I1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC49.47■■■■■ 5.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms