Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGA11Q9UKX5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGA11Q9UKX5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms