Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF3C4Q9UKN8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms