Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA1Q9UIW2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLXNA1Q9UIW2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PLXNA1Q9UIW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PLXNA1Q9UIW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PLXNA1Q9UIW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLXNA1Q9UIW2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLXNA1Q9UIW2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms