Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NXF1Q9UBU9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXF1Q9UBU9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms