Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP28Q9P2N2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms