Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH10Q9P2E7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms