Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC43.88■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
CCDC180Q9P1Z9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC43.81■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.77■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
CCDC180Q9P1Z9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
CCDC180Q9P1Z9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms