Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXXC1Q9P0U4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXXC1Q9P0U4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms