Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMPD4Q9NXE4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMPD4Q9NXE4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMPD4Q9NXE4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms