Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms