Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNGB3Q9NQW8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNGB3Q9NQW8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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