Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYLDQ9NQC7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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