Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LHX9Q9NQ69 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX9Q9NQ69 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX9Q9NQ69 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LHX9Q9NQ69 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX9Q9NQ69 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX9Q9NQ69 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX9Q9NQ69 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LHX9Q9NQ69 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms