Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAM60AQ9NP50 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms