Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM8AQ9HCN3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM8AQ9HCN3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms