Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ROPN1BQ9BZX4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms