Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A5Q9BY07 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms