Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MXRA8Q9BRK3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms