Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOPXQ9BPY8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms