Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RSF1Q96T23 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC38■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RSF1Q96T23 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RSF1Q96T23 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms