Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHF12Q96QT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF12Q96QT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms