Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF558Q96NG5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms