Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT74Q96LB3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IFT74Q96LB3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IFT74Q96LB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT74Q96LB3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT74Q96LB3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT74Q96LB3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms