Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX27Q96L92 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX27Q96L92 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms