Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HIC2Q96JB3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIC2Q96JB3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms