Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IMP4Q96G21 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMP4Q96G21 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms