Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX11Q96FC9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX11Q96FC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX11Q96FC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX11Q96FC9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX11Q96FC9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX11Q96FC9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX11Q96FC9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms