Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRN2Q92932 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRN2Q92932 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms