Protein–RNA interactions for Protein: Q92560

BAP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BAP1Q92560 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BAP1Q92560 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BAP1Q92560 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms