Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ripply3Q924S9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms