Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GATAD2BQ8WXI9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms