Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC4Q8WW27 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC4Q8WW27 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms